2n3565_tokyo 
エレキ→オーディオインターフェース→アンプシム、という接続です。入力のINSTとLINEはINSTで合っていますか？
ハムバッカーで強く弾くと赤ランプが点く時があります。ゲインをどこまで下げていいのかも知りたいです。
パッシブギターを直接つなぐなら、基本はINSTまたはHi-Zです。ギター向けの高い入力インピーダンスになり、LINE入力より高域や音量が自然になりやすいです。アクティブDIやプリアンプのライン出力を入れる場合は、その機器の出力に合わせてLINEを選びます。
赤くなるなら入力ゲインを下げ、強く弾いたピークでもクリップしない余裕を残してください。録音時に小さく見えても、後から音量は上げられます。アンプシミュレーターの入力段でも歪んでいないか確認すると切り分けやすいです。
2n3565 コメント
はい。常に大きな波形を録るより、予想外に強く弾いてもクリップしない方が重要です。DAW側のメーターとインターフェース本体のランプを両方見て、録音後はプラグインやトラックフェーダーで聴きやすい音量へ調整してください。
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INSTで、強く弾いても赤くならない所まで下げる。これでやってみます。波形の小ささは気にしすぎなくていいんですね。